Analiza polimorfizmów pojedynczych nukleotydów genów DGCR8 i XPO5 oraz ich związek z występowaniem jaskry pierwotnej otwartego kąta

Cel
analiza polimorfizmów pojedynczych nukleotydów genów szlaku obróbki miRNA: DGCR8 i XPO5, oraz ich związek z występowaniem jaskry pierwotnej otwartego kąta.

Materiał i metody
materiał do badań stanowiła krew pobrana od chorych na jaskrę pierwotną otwartego kąta oraz od dopasowanej wiekowo grupy osób niedotkniętych tą chorobą. Liczebność grup dla rs3757 DGCR8 w grupie kontrolnej wynosiła 135, w grupie badanej 137, dla rs11077 XPO5 – 140 w grupie kontrolnej oraz 138 w grupie badanej. Z limfocytów krwi obwodowej został wyizolowany DNA. Oznaczenie częstości wariantów polimorficznych zostało przeprowadzone z wykorzystaniem zestawu TaqMan® SNP Genotyping Assays, który umożliwia odczyt genotypu podczas analizy reakcji łańcuchowej polimerazy DNA w czasie rzeczywistym.

Wyniki
wyniki wykazały, że heterozygota AG polimorfizmu DGCR8 rs3757 występowała głównie u osób, u których nie stwierdzono jaskry pierwotnej otwartego kąta (P = 0,001), homozygota GG natomiast dominowała u osób nią dotkniętych (P = 0,003). Nie wykazano istotnego statystycznie związku między występowaniem genotypów AC i CC polimorfizmu rs11077 w genie XPO5 a ryzykiem wystąpienia jaskry pierwotnej otwartego kąta.

Wnioski
wiele doniesień wskazuje na związek między zmienionym poziomem miRNA a patogenezą jaskry. Polimorfizmy pojedynczych nukleotydów w genach DGCR8 i XPO5, kodujących białka szlaku dojrzewania miRNA, mogą być kluczowe dla tego procesu. W przeprowadzonym badaniu wykazano, że genotyp AG polimorfizmu rs3757 DGCR8prawdopodobnie ma efekt protekcyjny, zmniejszający ryzyko zachorowania na jaskrę pierwotną otwartego kąta, genotyp GG natomiast może być związany ze zwiększonym ryzykiem zachorowania. Analiza pozostałych genów szlaku obróbki miRNA może pomóc w oznaczeniu wariantów polimorficznych związanych z podwyższonym ryzykiem wystąpienia jaskry pierwotnej otwartego kąta i zakwalifikowaniu bardziej podatnych na zachorowanie osób do grupy podwyższonego ryzyka.



Purpose
To analyse the single nucleotide polymorphisms of DGCR8 and XPO5 genes, involved in miRNA processing pathway, in relation to the incidence of primary open-angle glaucoma.

Material and methods
Blood samples as the biological material used for the experiment were voluntarily donated by patients with known primary open-angle glaucoma and age-matched healthy controls. The two control groups – rs3757 DGCR8 and rs11077 XPO5 – consisted of 135 and 140 volunteers, respectively. The two study groups – rs3757 DGCR8 and rs11077 XPO5 – consisted of 137 and 138 subjects, respectively. The polymorphic variant frequencies of rs3757 and rs1107 were determined using DNA isolated from the peripheral blood lymphocytes in TaqMan® SNP Genotyping Assays.

Results
The statistical analysis revealed that the genotype AG of DGCR8 rs3757 occurred more frequently in healthy individuals (P = 0.001), while homozygote GG was present mostly in people affected by primary open-angle glaucoma (P = 0.003). No association between the risk of primary open angle glaucoma and AC/CC genotypes of XPO5 was found.

Conclusions
Many reports suggest the association between the miRNA alteration and the pathogenesis of glaucoma. The single nucleotide polymorphisms in DGCR8 and XPO5genes, involved in microRNA biogenesis, may be the key factor in this process. Our experiment showed that genotype AG in rs3757 DGCR8 exhibits protective effect, decreasing the risk of primary open angle glaucoma, while the homozygote GG is probably associated with increased risk of glaucoma. The analysis of polymorphic variants of the genes involved in miRNA biogenesis could enable identification of glaucoma high-risk groups.